A Bölcsészettudományi Kutatóközpont az akadémiai kutatóhálózat megújításának eredményeként az MTA Filozófiai Kutatóintézetnek, az MTA Irodalomtudományi Intézetnek, az MTA Művészettörténeti Kutatóintézetnek, az MTA Néprajzi Kutatóintézetnek, az MTA Régészeti Intézetnek, az MTA Társadalomkutató Központnak és az MTA Zenetudományi Intézetnek az MTA Történettudományi Intézetbe történő beolvadásával 2012. január 1-jével jött létre MTA Bölcsészettudományi Kutatóközpont néven. Neve 2019. szeptember 1-jétől: Bölcsészettudományi Kutatóközpont. Az Eötövös Loránd Kutatási Hálózat tagja.

A kutatóközpont intézeti szintű szervezeti egységei:

Bölcsészettudományi Kutatóközpont Filozófiai Intézet

Institute of Philosophy, Research Centre for the Humanities

Igazgatóság, elérhetőségek

Bölcsészettudományi Kutatóközpont Irodalomtudományi Intézet

Institute for Literary Studies, Research Centre for the Humanities

Igazgatóság, elérhetőségek

Bölcsészettudományi Kutatóközpont Művészettörténeti Intézet

Institute for Art History, Research Centre for the Humanities

Igazgatóság, elérhetőségek

Bölcsészettudományi Kutatóközpont Néprajztudományi Intézet

Institute of Ethnology, Research Centre for the Humanities

Igazgatóság, elérhetőségek

Bölcsészettudományi Kutatóközpont Régészeti Intézet

Institute of Archaeology, Research Centre for the Humanities

Igazgatóság, elérhetőségek

Bölcsészettudományi Kutatóközpont Történettudományi Intézet

Institute of History, Research Centre for the Humanities

Igazgatóság, elérhetőségek

Bölcsészettudományi Kutatóközpont Zenetudományi Intézet

Institute of Musicology, Research Centre for the Humanities

Igazgatóság, elérhetőségek 

Bölcsészettudományi Kutatóközpont Archeogenomikai Intézet

Institute of Archaeogenomics, Research Centre for the Humanities

Igazgatóság, elérhetőségek 

Bölcsészettudományi Kutatóközpont Moravcsik Gyula Intézet

Gyula Moravcsik Institute, Research Centre for the Humanities